Aktif çamur arıtmasında, bazen akışta toksik maddelerin varlığı nedeniyle atık su arıtmasında dalgalanmalar olabilir.zehirli maddeler mikroorganizmaları etkinliklerini azaltmak ya da kaybetmek için nasıl etkilerBurada etkinlik kaybı, nitrifye bakteriler tarafından azot işleme yeteneğinin kaybına özel olarak atıfta bulunur.Öncelikle mikroorganizmaların (özellikle nitrifye edici bakterilerin) organik maddeyi işleme getirme genel mekanizmasını anlamamız gerekir.Mikroorganizmaların yüzeyi spesifik özellikleri olan reseptörlerle kaplıdır.ve eşleşen reseptör bakterilerin yüzey kanallarını açıp vücuda işlem için girmelerine izin verir.Etkinlik mekanizması, anahtarlar ve kilitlere benzer.Toksik maddeler su kütlesine girdikten sonra, mikroorganizmaları doğrudan delerek ölümlerine neden olurlar.veya toksik maddenin molekülleri reseptöre girer ama mikrobiyal vücuda giremez.Daha fazla toksik maddenin olduğu sürece, daha fazla geçici kanal kullanılır ve bakterilerin yüzeyinde daha az reseptör kanalı kullanılır.İşleme yetenekleri ne kadar zayıf olursa.